paragongenomics適用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex®

該基于擴增子的SARS-CoV-2 NGS面板專為COVID19冠狀病毒研究和監(jiān)測而設(shè)計，可對負責(zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進行完整的基因組測序。該面板專門針對MGI Tech的DNBSEQ平臺。其他版本可用于  Illumina測序平臺。 

SKU：paragongenomics 918001

類別：CleanPlex對于MGI，CleanPlex為MGI現(xiàn)成的使用面板，傳染病，產(chǎn)品，準備到使用NGS面板標簽：靶富集，靶向測序，擴增子測序，多重PCR，下一代測序，定向重測序，NGS面板，NGS測定，PCR擴增子測序，SARS-CoV的-2 ，研究面板，COVID19，2019-nCoV，傳染性疾病監(jiān)測

產(chǎn)品描述

用于MGI SARS-CoV-2的CleanPlex®面板，用于通過MGI Tech的DNBSEQ平臺上的下一代測序（NGS）的基于擴增子的靶標富集檢測，跟蹤和研究COVID19冠狀病毒

Paragon Genomics設(shè)計了一個高度多重的靶標富集板，覆蓋了SARS-CoV-2病毒的整個基因組（末端的92個堿基除外）。該小組能夠?qū)ω撠?zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進行完整的基因組測序和流行病學(xué)研究。借助Paragon Genomics CleanPlex技術(shù)，可在5小時內(nèi)將病毒的整個基因組從RNA擴增到序列就緒的文庫。該面板的兩個版本可用于兩個主要的測序平臺：Illumina和MGI。CleanPlex技術(shù)可輕松，靈活地對樣品進行測序，以確保對傳染病的監(jiān)測和研究。

強調(diào)

• 節(jié)省大量成本
  降低測序成本98％。許多散彈槍宏基因組測序方法所需的每個樣品僅需要0.2M讀數(shù)，而  1000萬個讀數(shù)。
• 目標區(qū)域的高覆蓋率
  整個SARS-CoV-2基因組的覆蓋率達到99％
• 靈敏檢測
  可以高置信度檢測多達1個拷貝，而RT-qPCR可以檢測3-5個拷貝（1）
• 快速，簡化的工作流程
  使用快速的四步協(xié)議（包括RT步驟）以少的動手時間，只需5.5小時即可生成可測序的文庫。
• 性能超群
  準備高質(zhì)量的NGS庫具有優(yōu)良的對目標使用CleanPlex技術(shù)，使高效利用測序讀取性能。CleanPlex專家組的準靶率通常比混合捕獲的小靶標富集專家組的靶率高得多。

CleanPlex SARS-CoV-2面板包含帶有RT組件的CleanPlex多重PCR引物和CleanPlex靶向庫試劑盒。CleanPlex索引PCR引物和CleanMag ^®  磁珠單獨訂購?fù)瓿蓮妮斎隦NA工作流測序就緒NGS庫。

儲存溫度

儲存在-20°C。

（1）Corman VM等。通過實時RT-PCR檢測（2019-nCoV）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

僅供研究使用。不用于診斷過程。

（左）使用含有SARS-CoV-2的N和S基因的質(zhì)粒，通過一個單一的工作流程進行檢測，顯示了低拷貝數(shù)下的檢測率。結(jié)果表明，檢出率為1.1份時為56％，當存在2份以上時為100％。通過使用兩個池來覆蓋整個病毒基因組，預(yù)期靈敏度只會進一步提高。（右）對于檢測到的這些，該小組能夠平均捕獲10倍讀取深度范圍內(nèi)的所有靶標，以獲得2.8個病毒拷貝，類似地，除了一個靶標外，所有靶標均捕獲1.4個病毒拷貝。所有目標也均勻分布在整個GC范圍內(nèi)。

附加信息